Pagrindinis skirtumas tarp alelopatijos ir antibiozės yra pagrįstas kiekvieno reiškinio sukeltu poveikiu. Alelopatija daro teigiamą ir neigiamą poveikį dviejų ar daugiau organizmų santykiams, tuo tarpu antibiozė neigiamai veikia vieną iš santykiuose dalyvaujančių organizmų.
Mityba vaidina svarbų vaidmenį išgyvenant organizmus. Atsižvelgiant į tai, gyvybiškai svarbus organizmų santykis, reikalingas maistinėms medžiagoms. Tiek alelopatija, tiek antibiozė yra santykiai, vykstantys tarp dviejų ar daugiau organizmų. Tačiau jie reaguoja vienas į kitą skirtingomis formomis.