Esminis skirtumas tarp ektomikorrhizų ir endomikorizų yra tas, kad grybelinės hifos neprasiskverbia į ektomikorrhizose esančių augalų šaknų žievės ląsteles, o grybelinės hifos prasiskverbia į endomikorrhizų augalų šaknų žievės ląsteles.
Mikorizos yra svarbus simbiotinis ryšys, atsirandantis tarp grybų ir aukštesnių augalų šaknų. Tiek grybai, tiek augalai gauna naudos iš šios asociacijos. Grybelinės hifos prasiskverbia į dirvą ir patenka į maistines medžiagas, o augalai taip pat teikia naudos grybams. Vadinasi, tai yra ekologiškai svarbus santykis. Svarbiausia, kad grybelinės hifos gali užaugti kelis metrus ir pernešti vandenį bei maistines medžiagas, ypač azotą, fosforą, kalį, į šaknis. Be to, mikorizės asociacija apsaugo augalą nuo šaknų patogenų. Taigi maistinių medžiagų trūkumo simptomai rečiau pasireiškia augaluose, kurie yra šiose simbiotinėse asociacijose. Yra dvi mikorizų rūšys: ektomikorizės ir endomikorizės.
