Pagrindinis skirtumas tarp cis ir trans-riebalų rūgščių yra tas, kad cis riebalų rūgštys turi du vandenilio atomus, prijungtus prie dvigubo ryšio toje pačioje anglies grandinės pusėje, o trans-riebalų rūgštys turi du vandenilio atomus, susietus su dviguba jungtimi priešingai. anglies grandinės pusėse.
Riebalų rūgštys yra karboksirūgštys, turinčios ilgas alifatines anglies grandines, kurios yra sočios arba nesočios. Tai reiškia, kad alifatinėje grandinėje gali būti dvigubi ryšiai tarp anglies atomų arba jų nėra. Cis ir trans-riebalų rūgštys yra dvi nesočiųjų riebalų rūgščių formos.