Pagrindinis skirtumas tarp mineralinių rūgščių ir organinių rūgščių yra tas, kad mineralinėse rūgštyse iš esmės nėra anglies ir vandenilio, o organinėse rūgštyse iš esmės yra anglies ir vandenilio atomų.
Mineralinės rūgštys vadinamos „neorganinėmis rūgštimis“, nes šie junginiai turi skirtingus skirtingų cheminių elementų derinius ir yra gaunami iš neorganinių junginių. Todėl tai yra neorganiniai junginiai, turintys rūgščių savybių. Kita vertus, organinės rūgštys yra tos, kuriose iš esmės yra anglies ir vandenilio. Vadinasi, jie yra rūgštinių savybių organiniai junginiai.