Pagrindinis skirtumas tarp peptido ir dipeptido yra tas, kad peptidas yra trumpa aminorūgščių grandinė, jungianti peptidinius ryšius, o dipeptidas yra peptido forma, turinti dvi amino rūgštis, sujungtas su viengubu peptido ryšiu, arba vieną amino rūgštį su du peptidiniai ryšiai.
Aminorūgštys yra baltymų pagrindas. Todėl jie tarpusavyje sudaro peptidinius ryšius, formuodami trumpas aminorūgščių grandines; mes juos vadiname „peptidais“. Ilgos ir ištisinės peptidų grandinės yra „polipeptidai“. Šios polipeptidinės grandinės jungiasi viena su kita ir sudaro baltymus. Terminas peptidas yra įprastas terminas, kurį vartojame trumpai aminorūgščių grandinei pavadinti, tačiau dipeptido terminas yra specifinis terminas, kurį naudojame tam tikro tipo peptidams įvardyti.
