Pagrindinis skirtumas tarp Caimano ir aligatoriaus yra jų gyvenamojoje vietoje. Kaimanai gyvena Pietų ir Centrinėje Amerikoje, o aligatoriai - JAV pietryčiuose ir Rytų Kinijoje. Jie skiriasi ir savo porūšiais. Kaimanas priklauso caimaninae porūšiui, o aligatorius - alligatorinae porūšiui.
Caimanas ir aligatorius yra du krokodilai kaip gyvūnai. Jie priklauso roplių gyvūnų grupei. Tačiau nuo krokodilų jie skiriasi keliomis savybėmis. Abu gyvūnai yra šaltakraujai ir gyvena šiltame klimate. Jie yra pusiau vandens ir mėsėdžiai. Jie gyvena gėlavandenėse buveinėse ir yra Alligatoridae šeimos nariai. Tačiau kaimanas priklauso caimaninae porūšiui, o aligatorius - alligatorinae porūšiui.