Pagrindinis skirtumas tarp bakterijų endosporų ir grybelių sporų yra dviejų tipų sporų ląstelių organizavimas. Bakterinės endosporos yra neveikiančios struktūros, esančios prokariotinėse bakterijose. Grybelinės sporos yra reprodukcinės struktūros, esančios eukariotiniuose grybuose.
Bakterijų ląstelėse yra bakterijų endosporų, kurios yra neveikiančios struktūros, galinčios išgyventi sunkiomis aplinkos sąlygomis. Todėl šios endosporos dygsta, kai įvykdomos tinkamos aplinkos sąlygos. Priešingai, grybelinės sporos yra egzosporos, kurios išsiskiria į išorę sporuliacijai.
