Pagrindinis skirtumas - metabolizmas ir metabonomika
Metabolitai yra mažos molekulės, dalyvaujančios metabolinėse reakcijose ląstelėse. Metabolitai apima tarpinius metabolinius metabolitus, hormonus, antrinius metabolitus, signalines molekules ir kt. Jie yra ląstelių biocheminių reakcijų veikiančios molekulės. Visas biologinio mėginio arba vieno organizmo metabolitų rinkinys yra žinomas kaip metabolomas. Metabolome yra dinamiška kolekcija, kuri keičiasi kas sekundę kūne. Metabolomika ir metabonomika yra du terminai, susiję su organizmo metabolomo tyrimais. Pagrindinis metabolomikos ir metabonomikos skirtumas yra tas, kad metabolomikai labiau rūpi normali endogeninė apykaita ir medžiagų apykaitos profiliavimas ląstelių ar organų lygiu, tuo tarpu metabonomika labiau susijusi su medžiagų apykaitos profilio išplėtimu teikiant informaciją apie medžiagų apykaitos sutrikimus dėl aplinkos veiksnių, ligų, žarnyno. mikroorganizmai ir metabolizmo profilių palyginimas ir kt. Metabolomiką daugiausia lemia masių spektrometrija, o metabonomika naudoja BMR spektroskopiją metabolitų analizei.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra metabolometika
3. Kas yra metabonomika
4. Palyginimas greta - metabolometika ir metabonomika
5. Santrauka
Kas yra metabolometika?
Metabolomika yra medžiagų apykaitos procesų, vykstančių ląstelėse, biologiniuose skysčiuose, audiniuose ar organizmuose, tyrimas. Tai apima ląstelių metabolitų identifikavimą ir kiekybinį įvertinimą naudojant geras analitines ir statistines priemones. Metabolomika laikoma svarbiu tyrimu, nes ji atskleidžia informaciją apie organizmo metabolizmą.
Norėdami tirti metabolinių reakcijų substratus ir produktus, metabolomika naudoja masių spektrometriją kaip analitinę platformą. Masių spektrometrija atskleidžia metabolitų rūšis ir jų koncentracijas, atspindinčią faktinę ląstelių ar audinių biocheminę būseną. Taigi metabolomika gali būti laikoma geriausiu organizmo molekulinio fenotipo atstovu. Metabolomika yra mažų organizmų molekulių omų technologija, palyginti su kitais ominiais tyrimais; metabolomika yra labai svarbi, nes ji tiesiogiai atspindi dabartinę ląstelių biocheminės reakcijos būklę.
Metabolomika taip pat gali būti laikoma proteomikos pratęsimu, nes ji susidaro dėl fermentų, kurie yra baltymai, veiklos, kaip parodyta kitame paveiksle.
01 pav. Metabolomikos schema
Kas yra metabonomika?
Metabonomika apibrėžiama kaip daugybinių parametrinių metabolinių reakcijų kiekybinis matavimas tam tikru metu, atsižvelgiant į patofiziologinius įtempius ar genetinę modifikaciją. Tai paprastai taikoma atliekant tyrimus apie žmogaus mitybą ir reakciją į vaistus ar ligas. Šio požiūrio pradininkas buvo Jeremy Nicholsonas iš Imperatoriškojo koledžo, Londone, ir jis buvo naudojamas daugelyje sričių, įskaitant toksikologiją, ligų diagnostiką, mitybą ir kt. Istoriškai metabonomika buvo vienas iš pirmųjų metodų, taikant sistemų biologijos sritį tyrimams metabolizmo.
Metabonomikai labiau rūpi palyginti biocheminius profilius, o ne nustatyti atskirus metabolinius junginius metabolomikoje. Todėl metabonomiką galima apibrėžti kaip metabolomikos pogrupį. Jame daugiausia pabrėžiama skirtingų populiacijų medžiagų apykaitos profilių palyginimas, atsižvelgiant į ligas, aplinkos stresą, genetinę modifikaciją, mitybą, vaistus ir kt., Nes metabolitai yra geri žymenys, rodantys ligos būklę, vaistų poveikį, aplinkos stresą, toksinų poveikį ir kt.
Metabonominiai tyrimai atskleidžia ir tarpląstelinius, ir tarpląstelinius metabolitus. Jis naudoja didelio našumo metodus, kad vienu metu ir pakartotinai analizuotų daugybę metabolitų, leidžiančių laiku ištirti ląstelių fiziologinę būklę. Tai taip pat atskleidžia koreliaciją tarp metabolitų ir patologinės organizmo būklės. Metabonominiams tyrimams paremti galima naudoti genomiką ir proteomiką, nes jos yra susijusios, kaip parodyta aukščiau esančiame paveiksle.
Kuo skiriasi metabolometika ir metabonomika?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Metabolomika ir metabonomika |
|
| Metabolomika yra viso organizmo metabolitų rinkinio tyrimas | Metabonomika yra kiekybinis gyvybinių sistemų daugiaparametrinių metabolinių atsakų į patofiziologinius dirgiklius ar genetinę modifikaciją tyrimas. |
| Pagrindinis rūpestis | |
| Metabolomika labiau susijusi su medžiagų apykaitos profiliavimu ir atskirų ląstelėse esančių metabolitų nustatymu. | Metabonomika labiau susijusi su metabolitų ar populiacijų metabolinių profilių palyginimu, susijusiu su genetinėmis modifikacijomis, ligomis, aplinkos stresais, patologiniais dirgikliais, vaistais ir kt. |
| Informacija | |
| Metabolomika daugiausia orientuota į endogeninį metabolizmą. | Metabonomika neapsiriboja vien endogeniniu metabolizmu. Ji apima informacijos apie medžiagų apykaitos sutrikimus, kuriuos sukelia vidiniai ir išoriniai veiksniai, pvz., Mitybos įpročiai, toksinai, ligos procesai ir kt. |
| Analitinės priemonės | |
| Ji naudoja masių spektrometriją kaip pagrindinę analitinę platformą | Metabonomika naudoja BMR spektroskopiją kaip pagrindinę analitinę platformą. |
Santrauka - Metabolomika ir metabonomika
Metabolomas reiškia visą mažų molekulių, vadinamų metabolitais, rinkinį, esantį ląstelėje ar organizme. Metabolomika yra viso metabolomo tyrimas, siekiant sukurti metabolinį pobūdį. Metabolomika leidžia mokslininkams išmatuoti faktinę ląstelės ar organizmo fiziologinę būklę. Metabonomika yra metabolomikos dalis, kuri apima informaciją apie gyvų sistemų daugiaparametrinius metabolinius atsakus į patofiziologinius dirgiklius ir genetines modifikacijas. Metabonomika yra susijusi ne tik su individualiu metaboliniu profiliavimu, pavyzdžiui, metabolomika; metabolizmo profiliai lyginami su kitais veiksniais, tokiais kaip aplinkos įtaka, ligos, toksinai ir kt. Tiek metabolomika, tiek metabonomika apima organizmų metabolitų tyrimus, kad būtų galima išmatuoti faktinę ląstelių fiziologinę būklę. Taigi,kartais šie du laikomi sinonimais, neatsižvelgiant į metabolomikos ir metabonomikos skirtumus.
