Pagrindinis skirtumas tarp radioaktyviųjų ir neradioaktyviųjų zondų yra tas, kad radioaktyvieji zondai yra viengrandės DNR arba RNR sekos, pažymėtos radioaktyviaisiais izotopais, o neradioaktyvieji zondai yra viengrandės DNR arba RNR sekos, pažymėtos chemine etikete arba fluorescuojančia žyme.
Nukleorūgščių hibridizacija yra svarbi molekulinės biologijos technika, ypač atliekant mikrobų diagnostiką. Tai padeda nustatyti ar aptikti tam tikrą nukleorūgščių seką. Taikant šią techniką, nukleorūgštys yra pritvirtintos prie kieto paviršiaus ir hibridizuojamos su zondu. Zondas yra DNR arba RNR fragmentas, papildantis dominančią seką. Jei mėginyje yra tikslinė seka, zondas su ja hibridizuosis ir ją bus galima aptikti. Yra dviejų tipų zondai: radioaktyvūs ir neradioaktyvūs zondai. Todėl zondus galime pažymėti radioaktyviąja ar fluorescuojančia žyma.