Pagrindinis skirtumas tarp vandenynų rūgštėjimo ir visuotinio atšilimo yra tas, kad vandenynų rūgštėjimas yra jūros vandens pH sumažėjimas visame pasaulyje dėl to, kad vandenynai absorbuoja didžiulį anglies dioksido kiekį iš atmosferos, o visuotinis atšilimas yra ilgalaikis laipsniškas vidutinės Žemės atmosfera.
Vandenynų rūgštėjimas ir visuotinis atšilimas yra dvi kylančios pasaulinės problemos. Jie atsiranda dėl padidėjusio CO 2 lygio atmosferoje. Kai CO 2 ištirpsta vandenyno vandenyje ir sumažina vandens pH, vyksta vandenynų rūgštėjimas. Kai CO 2 sulaiko saulės spindulių šilumos bangas ir padidina vidutinę Žemės atmosferos temperatūrą, vyksta visuotinis atšilimas. Todėl abu procesai yra neigiamos didžiulės žmogaus veiklos išmetamo CO 2 kiekio pasekmės.