Pagrindinis skirtumas tarp oligopeptido ir polipeptido yra tas, kad oligopeptiduose yra nedaug aminorūgščių liekanų, o polipeptiduose yra daug aminorūgščių liekanų.
Terminai oligopeptidai ir polipeptidai priskiriami baltymų kategorijai. Peptidai yra trumpos aminorūgščių grandinės. Aminorūgštys jungiasi tarpusavyje per peptidinius ryšius. Todėl galime suskirstyti šiuos peptidus pagal aminorūgščių, esančių šiuose peptiduose, skaičių. Pvz., Dipeptidai, tripeptidai, tetrapeptidai, oligopeptidai ir polipeptidai.