Esminis skirtumas tarp citochromo ir fitochromo yra tas, kad citochromas yra elektronų hemo baltymas, dalyvaujantis aerobiniame kvėpavime. Tuo tarpu fitochromas yra fotoreceptoriaus baltymas, jautrus regimojo spektro raudonai ir toliai raudonai šviesai.
Gyvieji organizmai turi skirtingus pigmentų tipus. Kai kurie yra šviesą sugeriantys, o kiti - kvėpavimo pigmentai. Citochromas yra metaloproteinas, kuris veikia kaip elektronų nešėjas aerobiniame kvėpavime. Tuo tarpu fitochromas yra fotoreceptorius, kuris sugeria raudoną ir tolimą raudoną šviesą iš matomo spektro. Palyginti su citochromu, fitochromai yra svarbūs daugeliu augalų vystymosi aspektų.