Pagrindinis skirtumas tarp AMPA ir NMDA receptorių yra tas, kad specifinis AMPA receptorių agonistas yra alfa-amino - 3 - hidroksil - 5 - metil - 4 - izoksazolo propiono rūgštis (AMPA), o specifinis NMDA receptorių agonistas yra N - metilas. - D - aspartatas (NMDA).
Yra trys pagrindiniai glutamato receptorių tipai. Jų skirtumas pagrįstas agonistu, kuris jungiasi dėl glutamato jungimosi receptoriaus aktyvacijos. Susijungimas su glutamatu atvers jonų kanalus natrio ir kalio jonams pernešti. Be to, NMDA receptoriai taip pat palengvina kalcio jonų srautą per membraną.