Pagrindinis skirtumas tarp motorinio ir jutiminio homunkulio yra kiekvieno tipo apdorojimo tipas neurologinio kartografavimo metu. Motorinis homunculas yra žemėlapis, rodantis įvairių anatominių kūno dalių motorinį apdorojimą, o jutiminis - tai skirtingų anatominių kūno dalių jutiminis apdorojimas.
Homunkulas yra įsivaizduojamas žemėlapis, sukurtas remiantis turimais duomenimis apie skirtingus neurologinius ryšius. Tai daugiausia apima smegenis, jutiminį ir motorinį apdorojimą. Be to, nervai ir nugaros smegenys taip pat vaidina svarbų vaidmenį kuriant homunkulą.
