Pagrindinis skirtumas tarp ubichinonų ir citochromų yra tas, kad ubikinonai (CoQ) nėra baltymai, o citochromai yra baltymai.
Elektronų transportavimo grandinė yra paskutinė aerobinio kvėpavimo stadija. Todėl tai įvyksta vidinėje mitochondrijų membranoje. Be to, jis susideda iš elektronų nešiklių, kurie palengvina protonų gradiento susidarymą per membraną. Išskyrus NAD ir flavoproteinus, ubikinonai ir citochromai yra dviejų tipų elektronų nešėjai, dalyvaujantys elektronų transportavimo grandinėje. Ubiquinonai yra baltymuose netirpios hidrofobinės organinės molekulės, o citochromai yra geležies turintys baltymai.