Pagrindinis skirtumas tarp glikogeno ir gliukozės yra tas, kad glikogenas yra polisacharidas, kaupiantis angliavandenius gyvūnuose ir grybuose, o gliukozė yra gausiausias monosacharidas, veikiantis kaip pagrindinis energijos šaltinis ląstelėse.
Angliavandeniai yra organiniai junginiai, kuriems būdingi anglies, vandenilio ir deguonies elementai. Vandenilio ir deguonies santykis yra 2: 1 angliavandeniuose, panašus į vandenį. Angliavandeniai yra labai svarbūs plačiai paplitę biologiniai junginiai, nes jie yra pagrindinis energijos šaltinis ir struktūrinė protoplazmos sudedamoji dalis. Paprastai angliavandeniai yra balti, kieti ir tirpūs organiniuose skysčiuose, išskyrus tam tikrus polisacharidus. Monosacharidai yra pagrindiniai angliavandenių molekulių vienetai, o svarbiausia iš jų yra gliukozė. Glikogenas taip pat yra angliavandeniai. Bet tai yra polisacharidas, susidarantis anabolizuojant gliukozės molekules į šakotą molekulę. Tiek gliukozė, tiek glikogenas yra svarbūs organizmo energijos gamybai. Gliukozė yra pagrindinis energijos gamybos kuras, o glikogenas yra antrinių,ilgalaikis energijos kaupimas gyvūnams ir grybams.
