Pagrindinis skirtumas tarp D ir L gliukozės yra tas, kad D-gliukozėje trys hidroksilo grupės ir viena vandenilio grupė yra dešinėje pusėje, o L-gliukozėje trys hidroksilo grupės ir viena vandenilio grupė yra kairėje pusėje.
„D“ir „L“raidžių nuoroda D-gliukozės ir L-gliukozės pavadinimuose naudojama struktūriniams gliukozės molekulės skirtumams atskirti. Šios dvi formos vadinamos enantiomerais, nes jų molekulinės struktūros yra vienas kito veidrodiniai vaizdai. Todėl pagrindinis skirtumas tarp D ir L gliukozės yra jų struktūra. Jų formų skirtumus galime paaiškinti naudodamiesi Fišerio projekcijos modeliu; tai yra vienas iš organinių molekulių piešimo būdų.