Pagrindinis skirtumas tarp protoksilemo ir metaksilemo yra tas, kad protoksilemas yra pirmasis susiformavęs pirminis ksilemas, turintis mažesnes ląsteles, ypač siaurus indus ir tracheidus, o metaksilemas yra vėliau susiformavęs pirminis ksilemas, turintis didesnes ląsteles, ypač platesnius indus, ir tracheidus.
Ksilemas yra vienas iš dviejų augalų kraujagyslių audinių tipų. Ksilemas vykdo vandens ir mineralų judėjimą aukštyn nuo šaknų iki kitų augalo dalių. Tai yra vamzdžio pavidalo struktūra, turinti įvairių tipų specializuotas ląsteles, įskaitant indų elementus, tracheidus, parenchimą ir skaidulas. Yra du ksilemų tipai: pirminis ksilemas ir antrinis ksilemas. Pirminis ksilemas vystosi pirminio augimo metu. Be to, pirminis ksilemas turi dvi dalis: protoksilemą ir metaksilemą. Tiek protoksilemas, tiek metaksilemas yra kilę iš prokambio pirminio augimo metu. Pirmiausia atsiranda protoksilemas, o po protoksilemo - metaksilemas.