Pagrindinis skirtumas tarp deguonies ir anglies dioksido yra tas, kad deguonis yra diatominė molekulė, turinti du deguonies atomus, o anglies dioksidas yra triatominė molekulė, turinti vieną anglies atomą ir du deguonies atomus.
Deguonies ir anglies dioksido dujos yra dvi svarbiausios žemės atmosferos sudedamosios dalys. Taip yra dėl jo svarbos gyviems organizmams. Lygiai taip pat mums kvėpavimui reikia deguonies, o kvėpavimo procese išsiskiria anglies dioksidas. Šio įkvepiamo deguonies mums reikia energijai (ATP) gaminti gyvų ląstelių viduje, vadinamame ląstelių kvėpavimu. Kita vertus, augalai naudoja anglies dioksidą fotosintezei gaminti angliavandenius. Taigi augalai palaiko deguonies ir anglies dvideginio pusiausvyrą atmosferoje.