Pagrindinis skirtumas tarp stomatų ir apsauginių ląstelių yra tas, kad stomos yra poros, išsidėsčiusios ant lapų, stiebų ir kt. Epidermio, o apsauginės ląstelės yra ląstelės, kurios supa ir reguliuoja stomatų atidarymą ir uždarymą.
Kvėpavimas ir fotosintezė yra du gyvybiškai svarbūs procesai augaluose. Abiejuose procesuose dujų mainai yra svarbūs. Stomata ir apsauginės kameros palengvina šį dujų mainų darbą gamyklose. Čia apsauginės ląstelės yra parenchimo ląstelės, ir jos yra stomatas supančios ląstelės. Apsauginės ląstelės kontroliuoja transpiraciją, kuri yra būtinas augalų sveikata išlaikantis procesas. Be to, apsauginėse ląstelėse yra chlorofilų. Taigi jie taip pat gali fotosintezuoti.