Pagrindinis skirtumas tarp fenotipo ir genotipo santykio yra tas, kad fenotipo santykis yra santykinis palikuonių skaičius arba modelis, pasireiškiantis matoma tam tikro bruožo išraiška, o genotipo santykis yra palikuonių pasiskirstymo modelis pagal genetinę sandarą.
Fenotipas ir genotipas yra du terminai, vartojami apibūdinant organizmo savybes genetikoje. Šie terminai padeda paaiškinti, kaip bruožai paveldi ir kaip jie evoliucionuoja. Vertinant konkretų požymį ar charakteristiką, fenotipas reiškia fizinę išraišką arba matomą charakteristiką, o genotipas - genetinę sudėtį arba genų rinkinį, atsakingą už charakteristiką. Abu terminai nepaprastai prisideda prie bruožų paveldėjimo tyrimo. Genotipas kartu su aplinkos veiksniais daro įtaką bruožo fenotipui. Paprastais žodžiais tariant, genai yra atsakingi už pastebimą charakteristikos išraišką, turint šiek tiek įtakos aplinkai. Kai kryžminate du asmenis,gautą palikuonių populiaciją galima analizuoti pagal fenotipo santykį ir genotipo santykį.
