Pagrindinis skirtumas tarp CFC ir HCFC yra tas, kad CFC yra tik anglies, fluoro ir chloro atomai, o HCFC yra vandenilio, anglies, fluoro ir chloro atomai. Dar svarbiau tai, kad CFC sukelia rimtą ozono sluoksnio ardymą, tačiau, palyginti su HCFC, ozono sluoksniui turi daug mažesnį poveikį.
Cheminės CFC ir HCFC struktūros yra susijusios viena su kita pagal šiose struktūrose esančius cheminius elementus. Kalbant apie cheminę struktūrą, skirtumas tarp CFC ir HCFC yra tas, kad CFC neturi vandenilio atomo, o HCFC yra vandenilio atomas. CFC yra gerai žinomas kaip ozono sluoksnio ardymo veiksnys. Vadinasi, tai kenksminga medžiaga. HCFC yra geras šios kenksmingos medžiagos pakaitalas.