Esminis skirtumas tarp „Punnett“kvadrato ir kilmės yra tas, kad „Punnett“kvadrate rodomi visi galimi genotipai, kuriuos galima paveldėti iš dviejų tėvų genotipų, o kilmės dokumentai atspindi tam tikro bruožo, ypač geno, paveldėjimą.
Punnetto kvadratas ir kilmė yra dviejų tipų įrankiai, padedantys nustatyti genų paveldėjimo tikimybę. Abu rodo tikimybę paveldėti palikuonims tam tikrą bruožą. Kitaip tariant, abu numato paveldėjimo modelius šeimos linijose. Taigi jie gali padėti nustatyti paveldimos vaiko ligos riziką. Punnetto kvadratas yra tiesiog grafinis būdas parodyti visus galimus genotipus, kurie gali pasireikšti dviejų tėvų vaikams.