Pagrindinis skirtumas tarp junginio heterozigotos ir dvigubos heterozigotos yra tas, kad junginys heterozigotas yra asmuo, turintis du skirtingus mutavusius alelius tam tikrame geno lokuse, o dvigubas heterozigotas yra asmuo, kuris yra heterozigotas dviejuose atskiruose genetiniuose lokusuose.
Paprastai genas turi du alelius, nes organizmai yra diploidiniai. Aleliai yra variantinės geno formos. Jie yra genetinėje chromosomos vietoje. Yra dominuojančių alelių, taip pat recesyvinių alelių. Jei asmuo turi du skirtingus alelius (vieną dominuojantį ir vieną recesyvų (Aa)) lokusui, mes jį vadiname heterozigotu. Sąlyga turėti du skirtingus geno alelius vadinama heterozigotine būsena. Junginė heterozigota ir dviguba heterozigota yra dviejų tipų heterozigotinės situacijos. Junginyje heterozigotoje yra du skirtingi mutavę aleliai tam tikrame geno lokuse. Dviguba heterozigota yra heterozigotinė dviem genų lokusams.
