Pagrindinis skirtumas tarp bakteriochlorofilo ir chlorofilo yra tas, kad anoksigeniniai fototrofai, tokie kaip purpurinės bakterijos, heliobakterijos ir žaliosios sieros bakterijos ir kt., Turi bakteriochlorofilus, o deguonies fototrofai, pavyzdžiui, žali augalai, dumbliai ir cianobakterijos, turi chlorofilus.
Yra dviejų tipų fotosintezė; deguonies fotosintezė ir anoksigeninė fotosintezė. Taip pat yra dviejų tipų fotosintetiniai pigmentai: chlorofilas ir bakteriochlorofilas. Deguonies fototrofai turi chlorofilą, o anoksigeniniai - bakteriochlorofilą. Bakteriochlorofilas ir chlorofilas yra panašūs pagal bendrą struktūrą. Bet jie skiriasi pakaitais aplink žiedą ir fitolio uodegos ilgiu bei pakeitimais. Yra keturi chlorofilų tipai, tuo tarpu septyni bakteriochlorofilų tipai.
