Pagrindinis skirtumas tarp chlorofilo A ir B yra tas, kad chlorofilas A yra pagrindinis augalų ir dumblių fotosintezės pigmentas, o chlorofilas B yra papildomas pigmentas, kuris renka energiją ir pereina į chlorofilą A.
Chlorofilas yra natūralių pigmentų šeima, esanti augaluose ir dumbliuose ir atsakinga už jų žalią spalvą. Chlorofilas absorbuoja saulės spindulių energiją ir naudoja šią energiją angliavandeniams sintetinti iš vandens ir anglies dioksido. Tai procesas, vadinamas fotosinteze, kuris palaiko gyvybinius procesus visuose augaluose, nes per juos tenkinami jų energijos poreikiai. Be to, fotosintezė yra pagrindinis procesas, palaikantis visus gyvus organizmus, nes augalai yra visų maisto grandinių pirminiai gamintojai. Gyvūnai ir žmonės vartoja augalų produktus. Chlorofilo pigmentų šeimoje yra keli chlorofilo pigmentų tipai. Tarp jų chlorofilas A ir chlorofilas B yra dviejų tipų chlorofilai. Jie turi panašią struktūrą, šiek tiek skiriasi porfirino žiedas. Chlorofilas A turi CH3 porfirino žiedo grupės, o chlorofilas B porfirino žiede turi CHO (aldehido grupę).
