Pagrindinis skirtumas tarp heterozigotinių ir homozigotinių individų yra tas, kad heterozigotinis individas turi du skirtingus geno alelius (tiek dominuojančius, tiek recesyvinius), o homozigotinis - dvi to paties alelio kopijas, dominuojančias arba recesyvines.
Genai egzistuoja kaip aleliai arba kopijos. Iš tikrųjų genas daugiausia turi du alelius. Konkrečiau kalbant, alelis yra geno versija, sukelianti išskirtinį fenotipinį poveikį. Aleliai gali būti dominuojantys arba recesyviniai. Dominuojantys aleliai yra visiškai išreikšti heterozigotos fenotipu. Heterozigotiniai ir homozigotiniai individai yra dviejų tipų organizmai, skirstomi pagal esančių alelių tipus. Heterozigotinis individas yra organizmas, turintis tiek dominuojantį, tiek recesyvinį alelį. Homozigotinis individas yra organizmas, turintis du dominuojančius alelius arba du recesyvinius alelius.