Pagrindinis skirtumas tarp DNR ir cDNR yra tas, kad DNR yra ir egzonų, ir intronų, o cDNR yra tik egzonai.
DNR ir cDNR yra dviejų tipų nukleorūgštys, sudarytos iš dezoksiribonukleotidų. DNR yra viena iš svarbiausių gyvų organizmų makromolekulių, kuri sudaro genomą. Genome yra visa organizmo genetinė informacija. Tai sudaro skirtingų tipų sekas, įskaitant egzonus, kurie yra koduojančios sekos, ir intronus, kurie nėra koduojančios sekos. Kita vertus, cDNR arba papildoma DNR yra dar viena DNR forma, kurią mokslininkai dirbtinai sintetina iš mRNR molekulių. Kadangi cDNR gaunama iš mRNR šablonų, joje nėra nekoduojančių sekų ar intronų.