Pagrindinis skirtumas tarp biologinės kontrolės ir cheminės kontrolės yra tas, kad biologinė kontrolė naudoja gyvą organizmą kenkėjui naikinti, o cheminė kontrolė naudoja skirtingas sintetines chemines medžiagas kenkėjams naikinti.
Kenkėjai yra maži padarai, kurie žaloja, kenkia augalams ar naminiams gyvūnams. Be to, jie perduoda ligas, patiria ekonominių nuostolių ir kt. Kenkėjai puola skirtingus pasėlius ir sukelia didžiulius nuostolius žemės ūkyje. Todėl kenkėjų kontrolė yra sunki užduotis, ji kontroliuojama taikant cheminius metodus. Tačiau cheminės medžiagos nėra ekologiškos. Jie sukelia ir aplinkos, ir sveikatos problemų. Todėl mokslininkai sukūrė biologinius kenkėjų kontrolės metodus, kurie yra ekologiški ir tvarūs. Biologinėje kontrolėje dalyvauja gyvas organizmas arba organizmų grupė. Taigi jų poveikis aplinkai yra mažesnis. Cheminė kontrolė gali pakenkti aplinkai ir sukelti sveikatos problemų.
