Pagrindinis skirtumas tarp geografinės ir reprodukcinės izoliacijos yra tas, kad geografinė izoliacija yra reprodukcinės izoliacijos kategorija, nurodanti organizmų populiacijų atskyrimą nuo poravimosi ar jų genetinės medžiagos keitimo fizinėmis ribomis, o reprodukcinė izoliacija - mechanizmų, užkertančių kelią rūšims, rinkinį. nuo poravimosi ir vaisingų palikuonių.
Tręšimas yra spermos ir kiaušialąstės susijungimas, susidarant diploidinei zigotei lytinio dauginimosi metu. Jei pagaminta zigota yra subrendusi, ji galiausiai išaugs į sveiką vaisingą palikuonį. todėl reprodukcinė izoliacija yra procesas, kuris užkerta kelią vaisingų palikuonių susidarymui. Ši prevencija gali pasireikšti apvaisinimo proceso metu arba po apvaisinimo. Bet kokiu atveju, galų gale, tai sukuria barjerą vaisingoms palikuonims, kurie gali atsivesti kitą vaisingą palikuonį. Tarp skirtingų mechanizmų geografinė izoliacija yra reprodukcinės izoliacijos veiksnys.