Pagrindinis skirtumas - VNTR ir STR
DNR tyrimai yra nepaprastai naudingi suprantant ir nustatant filogenetinius ryšius, diagnozuojant genetines ligas ir atvaizduojant organizmo genomus. Keletas metodų, susijusių su DNR analize, naudojami tam tikram genui ar DNR sekai nustatyti nežinomos DNR telkinyje. Jie yra žinomi kaip genetiniai žymenys. Genetiniai žymekliai naudojami molekulinėje biologijoje, siekiant nustatyti genetinius skirtumus tarp individų ir rūšių. Kintamo skaičiaus tandeminis kartojimas (VNTR) ir trumpas tandeminis pakartojimas (STR) yra dviejų tipų genetiniai žymenys, rodantys asmenų polimorfizmą. Abi rūšys yra nekoduojančios besikartojančios DNR, kurios yra tandeminės. Jie išsidėstę chromosomose pagal galvą iki uodegos. VNTR yra genomo dalis, kurioje trumpa nukleotidų seka kartojama kelis kartus. STR yra dar viena DNR sekcija genome, kuri yra organizuota kaip besikartojantys vienetai, susidedantys iš dviejų iki trylikos nukleotidų šimtą kartų. Pagrindinis skirtumas tarp VNTR ir STR yra nukleotidų skaičius pasikartojančioje sekoje. Pasikartojantys VNTR vienetai susideda iš 10–100 nukleotidų, tuo tarpu besikartojantis STR vienetas susideda iš 2–13 nukleotidų. VNTR ir STR yra plačiai naudojami teismo medicinos tyrimuose.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra VNTR
3. Kas yra STR
4. VNTR ir STR panašumai
5. Gretimas palyginimas - VNTR ir STR lentelių pavidalu
6. Santrauka
Kas yra VNTR?
Tandeminis pakartojimas yra trumpa DNR seka, kuri kartojama nuo galvos iki uodegos tam tikrame chromosomų lokuse. Tandemo pakartojime nėra jokios kitos sekos ar nukleotido. Genome yra keli tandeminių pasikartojimų tipai. VNTR yra tandeminio pasikartojimo tipas, turintis pasikartojančius vienetus, susidedančius iš 10–100 nukleotidų. VNTR yra minisatelito rūšis. Šiuos tandeminius pasikartojimus galima rasti daugelyje chromosomų. Jie įsiterpę į žmogaus genomą ir yra daugiausia chromosomų subtelomeriniuose regionuose.
VNTR rodo tandeminį pakartotinį polimorfizmą tarp asmenų. VNTR ilgis tam tikroje chromosomos vietoje yra labai skirtingas dėl to, kad skiriasi tame DNR skyriuje organizuotų pasikartojančių vienetų skaičius. Todėl VNTR gali būti naudojamas kaip galingas įrankis identifikuojant asmenis, o VNTR analizė naudojama daugelyje sričių, įskaitant genetiką, biologijos tyrimus, kriminalistiką ir DNR pirštų spausdinimą. VNTR buvo pirmieji genetiniai žymenys, naudojami kaulų čiulpų transplantacijos persodinimui įvertinti. VNTR taip pat buvo pirmieji polimorfiniai žymenys, naudojami atliekant DNR profilį kriminalistikoje.
01 pav. VNTR kitimas šešiems asmenims
VNTR analizė atliekama per restrikcijos fragmento ilgio polimorfizmą, po kurio seka pietinė hibridizacija. Vadinasi, jai reikia palyginti didelio DNR mėginio. VNTR profilio aiškinimas taip pat problemiškas. Dėl šių apribojimų VNTR naudojimas teismo genetikoje buvo ribotas ir jį pakeitė STR analizė.
Kas yra STR?
STR yra labai besikartojantis DNR skyrius, susidedantis iš dviejų iki trylikos nukleotidų, besikartojančių vienetų, organizuotų tandemu. STR yra panašus į VNTR. Bet jis skiriasi nuo VNTR nuo nukleotidų skaičiaus pasikartojančioje sekoje ir pasikartojimų skaičiaus. STR yra mikrosatelito rūšis.
STR analizė, susijusi su tikslaus pasikartojančių vienetų skaičiavimu. STR yra labai skirtingi tarp asmenų, panašūs į VNT. STR profiliai kiekvienam žmogui skiriasi. Todėl molekulinėje biologijoje naudojama STR analizė, norint palyginti specifinius lokusus iš dviejų ar daugiau mėginių DNR. Taigi molekulinės biologijos metu STR yra laikomi galingais genetiniais žymenimis. Tai yra puiki priemonė identifikuoti asmenis dėl jų didelio polimorfizmo laipsnio ir gana trumpo ilgio.
Šiuo metu STR yra dažniausiai naudojama analizuojama genetinio polimorfizmo priemonė teismo genetikoje. Daugumoje kriminalistinių bylų nagrinėjama STR polimorfinė analizė. STR lokusai yra išplitę visame genome. Chromosomose yra tūkstančiai STR, kuriuos galima naudoti atliekant teismo ekspertizę. STR analizė neapima restrikcijos ilgio polimorfizmo, pavyzdžiui, VNTR analizės. STR analizė nenukerta DNR su restrikcijos fermentais. Norint pritvirtinti norimas sritis ant DNR, naudojami specifiniai zondai ir naudojant PGR metodą nustatomi STR ilgiai.
02 paveikslas: STR skirtumas tarp mėginių
Kuo panašūs VNTR ir STR?
- VNTR ir STR yra nekoduojanti DNR.
- Abu yra tandeminiai pakartojimai.
- Abu rodo individų polimorfizmą dėl DNR pjūvio ilgio skirtumo.
- Abu jie naudojami kaip galingi genetiniai žymenys atliekant DNR pirštų spausdinimą ir atliekant teismo medicinos tyrimus.
Koks skirtumas tarp VNTR ir STR?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
VNTR vs STR |
|
| VNTR yra nekoduojanti besikartojanti DNR, kurios trumpa nukleotidų seka kartojama tandeminiu būdu. | STR yra labai besikartojantis DNR skyrius, susidedantis iš dviejų iki trylikos nukleotidų, besikartojančių vienetų, organizuotų tandemu. |
| Dydis | |
| VNTR yra didesni nei STR. | STR yra mažesni nei VNTR. |
| Nukleotidų skaičius pasikartojančioje sekoje | |
| Pasikartojantis VNTR vienetas susideda iš 10–100 nukleotidų. | Kartojantis STR vienetas susideda iš 2–13 nukleotidų. |
Santrauka - VNTR ir STR
VNTR ir STR yra du galingi genetiniai žymenys, naudojami molekulinėje biologijoje, ypač teismo genetikos srityje. VNTR yra minisatelito tipas, o STR - mikrosatelitas. VNTR ir STR yra nekoduojanti, labai besikartojanti DNR. Jie kartojasi tandemu. Bendra VNTR ir STR struktūra yra ta pati. Tačiau besikartojančioje sekoje nukleotidų skaičius ir ilgis skiriasi. VNTR pasikartojančios sekos susideda iš 10–100 nukleotidų. STR turi pasikartojančias sekas, susidedančias iš 2–13 nukleotidų. Tai yra skirtumas tarp VNTR ir STR.
Atsisiųskite VNTR ir STR PDF versiją
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatų pastabose. Atsisiųskite PDF versiją čia Skirtumas tarp VNTR ir STR.
