Esminis skirtumas tarp UTR ir introno yra tas, kad UTR yra nekoduojanti nukleotidų seka, kuri yra įtraukta į subrendusią mRNR seką, o intronas yra seka, kuri nėra įtraukta į brandžią mRNR molekulę.
UTR arba neišversta sritis yra nekoduojanti seka, randama mRNR molekulėje. Kiekvienoje iRNR sekos pusėje galime pamatyti po vieną UTR. Todėl yra du UTR kaip 5'UTR ir 3'UTR. Priešingai, intronas yra nekoduojanti seka, randama tarp geno egzonų. Gaminant iRNR, intronai yra išsišakoję. Taigi intronai nėra matomi iRNR sekoje. Tačiau tiek UTR, tiek intronas yra svarbūs eukariotų genomų elementai.
