Esminis skirtumas tarp mūonų ir mezonų yra tas, kad mūonai yra tam tikros rūšies elementariosios dalelės, neturinčios jokio pagrindo, tuo tarpu mezonai yra tam tikrų rūšių chroniškos subatominės dalelės, turinčios porą kvarko ir anti-kvarko dalelių.
Muonai ir mezonai yra dviejų tipų dalelės materijoje. Muonai yra elementariųjų dalelių, tokių kaip elektronai, tipas ir mes negalime jų toliau skirstyti į mažesnes struktūras (pvz., Kvarkus). Bet mezonai yra šiek tiek didesni už mūonus ir juose yra kvarko ir antikvarko dalelių; taigi jie patenka į kitą kategoriją, vadinamą hadroninėmis subatominėmis dalelėmis. Sąvoka hadroninė priemonė reiškia, kad joje yra dvi ar daugiau kvarko dalelių, o subatominės dalelės yra mažesnės nei tomos struktūros, kurios sukuria atomo struktūrą.
