Pagrindinis skirtumas tarp hidrofobinių ir hidrofilinių aminorūgščių yra tas, kad hidrofobinės aminorūgštys yra nepolinės, o hidrofilinės - polinės.
Aminorūgštys yra baltymų pagrindas. Baltymai yra milžiniška polimero molekulė, kuri yra būtina visų gyvų organizmų sudedamoji dalis. Be to, aminorūgštys daugiausia yra dviejų rūšių, kaip nepakeičiamos ir nereikšmingos amino rūgštys. Be to, jas galime priskirti hidrofilinėms ir hidrofobinėms aminorūgštims, priklausomai nuo jų fizikinės ir cheminės prigimties. Jie skiriasi vienas nuo kito daugiausia dėl poliškumo.
