Pagrindinis skirtumas tarp failų sistemos ir duomenų bazės yra tas, kad failų sistema valdo tik fizinę prieigą, o duomenų bazė - fizinę ir loginę prieigą prie duomenų.
Duomenų bazė ir failų sistema yra du metodai, padedantys saugoti, gauti, valdyti ir manipuliuoti duomenimis. Abi sistemos leidžia vartotojui panašiai dirbti su duomenimis. Failų sistema yra neapdorotų duomenų failų, saugomų kietajame diske, rinkinys, o duomenų bazė skirta lengvai organizuoti, laikyti ir gauti didelius duomenų kiekius. Kitaip tariant, duomenų bazėje yra organizuotų duomenų paketas, paprastai skaitmeniniu pavidalu, skirtas vienam ar daugiau vartotojų. Santrumpa iš duomenų bazės yra DB. Galima klasifikuoti DB pagal jų turinį, pvz., Dokumento tekstą, bibliografinį ir statistinį. Svarbu pažymėti, kad net duomenų bazėje duomenys galiausiai arba fiziškai saugomi kai kuriuose failuose.
