Pagrindinis skirtumas - „Exome“ir „Transcriptome“
Gene yra koduojančių ir nekoduojančių regionų. Koduojančios sekos yra žinomos kaip egzonai, o nekoduojančios sekos - kaip intronai. Geno egzonų nukleotidų seka atspindi genetinį geno kodą, kad sintezuotų specifinį baltymą. Taigi, egzonai lieka iRNR molekulėje. Bendras genomo egzono regionas yra žinomas kaip egzomas, ir tai yra svarbi genomo dalis. Genų genetinis kodas paverčiamas iRNR molekulės genetiniu kodu, kuris reikalingas baltymų gamybai. Visos ląstelėje arba ląstelių populiacijoje vienu metu transkribuotos MRNR molekulės yra žinomos kaip transkripcijos. Esminis skirtumas tarp egzomo ir transkripto yra tas, kad egzomas reiškia genomo egzono regionų sekas, o transkripomas rodo bendrą ląstelės ar audinio mRNR tam tikru laiku.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra „Exome“
3. Kas yra „Transcriptome“
4. Palyginimas greta - „Exome“ir „Transcriptome“
5. Santrauka
Kas yra „Exome“?
Genai susideda iš egzonų, intronų ir reguliavimo sekų. Egzonai yra genų regionai, kurie transkripcijos metu perrašomi į mRNR seką. Transkripcijos metu intronai ir kiti nekoduojantys regionai pašalinami. Egzonų nukleotidų seka lemia geno, kuris sintetina specifinį baltymą, kodą, genetinį kodą. Baltymo iRNR lieka tik egzonai. Egzonų kolekcija genome yra žinoma kaip organizmo egzomas. Tai yra genomo dalis, išreikšta genais. Žmonėse egzomas sudaro 1% genomo. Tai baltymus koduojanti žmogaus genomo dalis.
01 paveikslas: „Exome“
Kas yra „Transcriptome“?
Transkripcija yra visų baltymus koduojančių ir nekoduojančių transkriptų (RNR) rinkinys tam tikrame audinyje. Transkriptomas rodo visų ląstelių ar audinių genų ekspresuotų mRNR molekulių rinkinį. Ląstelės transkripciją galima keisti su kito tipo ląstelių transkriptu. Transkripcija taip pat yra dinamiška - ji keičiasi laikui bėgant, reaguodama tiek į vidinius, tiek į išorinius dirgiklius. Net tame pačiame audinyje ar to paties tipo ląstelėje transkripcija gali pasikeisti po kelių minučių.
Transkripcija skiriasi nuo organizmo egzomo. Transkripcija apima tik išreikštas egzomų sekas. Nors ląstelės egzomas išlieka tas pats, transkriptaomas ląstelėse skiriasi, nes genų ekspresija nėra vienoda visoms ląstelėms ar audiniams. Skirtingose ląstelėse ir audiniuose yra išreikšti tik būtini genai. Genų ekspresija yra audinių ar ląstelių tipui būdingas procesas. Tai reguliuoja įvairūs veiksniai, įskaitant aplinkos veiksnius. Todėl transkripcija gali skirtis priklausomai nuo išorinės aplinkos sąlygų.
Transkripcija naudojama kaip proteomikos tyrimų pirmtakas. Visi baltymai yra gauti iš mRNR sekų. Transliacijos modifikacijos gali sukelti baltymų pokyčius. Tačiau transkripcija pateikia svarbią pagrindinę informaciją apie proteominius tyrimus.
02 paveikslas: embrioninių kamieninių ląstelių transkripcija
Kuo skiriasi „Exome“ir „Transcriptome“?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome yra baltymus koduojančių genų srities kolekcija. | Transkriptomas yra visos transkribuotos RNR, įskaitant ir MRN, rinkinys. |
| Pavyzdys | |
| Exome tiriamas naudojant DNR mėginį. | Transkripcija tiriama naudojant RNR mėginį. |
| Studijų metodas | |
| Visas egzomų sekvenavimas yra egzomo tyrimo metodas. | RNR sekos nustatymas yra transkripcijos tyrimo metodas. |
Santrauka - Exome vs Transcriptome
Egzonai yra koduojančios genų sekos ir lemia baltymų mRNR sekas. Šių koduojančių sekų (egzonų) rinkinys yra žinomas kaip organizmo egzomas. Prieš gaminant baltymus, genai perrašomi į mRNR molekules. Bendros ląstelės ar audinio MRN molekulės bet kuriuo metu yra žinomos kaip transkripcijos. Transkriptomas reiškia genus, kurie bet kuriuo metu yra aktyviai ekspresuojami į mRNR. Transkriptomas yra būdingas ląstelėms ir audiniams ir turi įtakos aplinkos sąlygoms. Tai skirtumas tarp egzomo ir transkripcijos.
