Pagrindinis skirtumas tarp mikrobranduolio ir makrobranduolio yra tas, kad mikrobranduolys yra mažesnis branduolys, kuriame yra ciliacinių pirmuonių gemalinės linijos genomas, o makrobranduolys yra didžiausias branduolys, kuriame yra somatinis ciliacinių pirmuonių genomas.
Branduolinis dimorfizmas yra dviejų skirtingų tipų branduolių tos pačios ląstelės reiškinys. Tai yra ypatinga pirmuonių ciliarų ir kai kurių foraminiferų savybė. Šie du branduoliai yra makrobranduolys ir mikrobranduoliai. Juose yra atskiri genomai. Makrobranduolys yra didesnis, kuris kontroliuoja ciliarinių pirmuonių metabolizmą, o mikrobranduoliai yra mažesnieji, atliekantys reprodukcines funkcijas ir generuojantys makrobranduolį.
