Pagrindinis skirtumas tarp izopentano ir neopentano yra tas, kad izopentane yra keturių narių anglies grandinė su viena metilo grupe, prijungta prie šios grandinės ties antruoju grandinės anglies atomu, o neopentane yra vienas anglies centras, prijungtas prie keturių metilo grupių.
Izopentanas ir neopentanas yra vienas kito struktūriniai izomerai. Todėl abu šie junginiai turi tą pačią cheminę formulę; C 5 H 12. Tačiau dėl izopentano ir neopentano skirtumų jų cheminėse struktūrose jie turi skirtingas chemines ir fizines savybes. Kitas pastebimas skirtumas tarp izopentano ir neopentano yra tas, kad izopentanas egzistuoja kaip bespalvis skystis, o neopentanas yra bespalvės dujos esant standartinei temperatūrai ir slėgiui.
