Pagrindinis skirtumas tarp glioksisomų ir peroksisomų yra tas, kad glioksisomų yra tik augalų ląstelėse ir gijiniuose grybuose, o peroksisomų yra beveik visose eukariotinėse ląstelėse. Gloksisomų gausu daigių sėklų augalų ląstelėse, o peroksisomų - kepenų ir inkstų ląstelėse.
Šie du organeliai yra mikrokūnai, esantys eukariotinėse ląstelėse. Glioksisomos yra specializuotos peroksisomos, randamos tik augalų ląstelėse ir gijiniuose grybuose. Peroksisomos yra organeliai, padedantys skaidyti ilgąsias riebalų rūgščių grandines ir detoksikuoti ląstelę. Jie skaido alkoholius ir kitus kenksmingus junginius.
