Pagrindinis skirtumas tarp acetilo CoA ir acilo CoA yra tas, kad acetilo CoA (arba acetilo koenzimas A) padeda metabolizuoti baltymus, angliavandenius ir lipidus, o acilo CoA (arba acilo koenzimas A) - riebalų rūgščių metabolizme.
Acetyl CoA yra labai naudingas pristatant acetilo grupę į Krebso ciklą energijos gamybai. Acetilo grupė yra funkcinė grupė, turinti cheminė formulė -C (O) CH 3. Acilo grupė taip pat yra funkcinė grupė, turinti cheminę formulę –C (O) R, kur R grupė yra riebalų rūgščių šoninė grandinė. Tai naudinga gaminant energiją paverčiant acetil CoA.
