Esminis skirtumas - bazės ekscizijos taisymas ir nukleotidų ekscizijos taisymas
DNR dažnai patiria žalą dėl įvairių vidinių ir išorinių veiksnių. Tačiau korinio ryšio sistemos nedelsdamos ir nuolat ištaiso žalą, kol jos tampa mutacijomis arba prieš perduodamos kitoms kartoms. Ląstelėse yra trijų tipų ekscizijos atstatymo sistemos: nukleotidų ekscizijos taisymas (NER), bazinės ekscizijos taisymas (BER) ir DNR neatitikimo taisymas (MMR), siekiant pašalinti vienos grandinės DNR pažeidimus. Pagrindinis skirtumas tarp bazinio ekscizijos taisymo ir nukleotidų ekscizijos taisymo yra tas, kad bazinės ekscizijos taisymas yra paprasta remonto sistema, veikianti ląstelėse, kad būtų pašalinti vieno nukleotido pažeidimai, sukelti endogeniškai, o nukleotidų ekscizijos remontas yra sudėtinga remonto sistema, veikianti ląstelėse, kad būtų galima palyginti didesni, pažeisti regionai sukelia egzogeniškai.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra pagrindo ekscizijos taisymas
3. Kas yra nukleotidų ekscizijos taisymas
4. Šoninis palyginimas - pagrindo ekscizijos ir nukleotidų ekscizijos taisymas
5. Santrauka
Kas yra „Base Excision Repair“?
Pagrindo ekscizijos taisymas yra paprasčiausia DNR taisymo sistemos versija, kurią turi ląstelės. Jis naudojamas nedidelių DNR pažeidimų šalinimui. DNR bazės yra modifikuotos dėl deamininimo arba alkilinimo. Kai yra bazės pažeidimų, DNR glikozilazė atpažįsta ir suaktyvina bazės ekscizijos atkūrimo sistemą ir ją atgauna fermentų AP endonukleazės, DNR polimerazės ir DNR ligazės pagalba. Šie veiksmai yra susiję su BER sistema.
- Netinkamos ar pažeistos bazės atpažinimas ir pašalinimas DNR glikozilaze, siekiant sukurti abazinę vietą (bazės praradimo vietos –apiurininės ar apirimidinės vietos).
- Apurininės / apirimidinės endonukleazės pjūvis nusižengus
- Likusio cukraus fragmento pašalinimas liazės ar fosfodiesterazės būdu
- Tarpų užpildymas DNR polimeraze
- Slapyvardžio uždarymas DNR ligaze
01 paveikslas. Pagrindo iškirpimo kelio atkarpos
Kas yra nukleotidų pašalinimo taisymas?
Nukleotidų ekscizijos taisymas (NER) yra svarbi ląstelių DNR ekscizijų taisymo sistema. Jis sugeba ištaisyti ir pakeisti pažeistus regionus iki 30 bazių ilgio ir jį nukreipia nepažeista šablono sruoga. Dažni DNR pažeidimai įvyksta dėl ultravioletinių spindulių, o NER apsaugo DNR taisydamas tuos pažeidimus prieš pat tapdamas mutacijomis ir perduodamas ateinančioms kartoms ar sukeldamas ligas. NER specialiai suteikia apsaugą nuo mutacijų, kurias netiesiogiai sukelia išoriniai veiksniai, tokie kaip aplinkos ir cheminiai kancerogenai. NER pastebimas beveik visuose organizmuose, ir jis atpažįsta žalą, kuri sukelia reikšmingą DNR spiralės iškraipymą.
NER procesas apima daugelio baltymų, tokių kaip XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB ir kt., Veikimą ir vyksta per kelis supjaustytus ir į pastas panašius mechanizmus. Šie baltymai yra būtini norint užbaigti taisymo procesą, o vieno iš NER baltymų defektas yra gyvybiškai svarbus ir gali sukelti retus recesyvinius sindromus: xeroderma pigmentosum (XP), Cockayne sindromą (CS) ir šviesai jautrią trapių plaukų sutrikimo formą. trichotiodistrofija (TTD).
02 paveikslas: Nukleotidų pašalinimo taisymas
Kuo skiriasi bazinis ekscizijos taisymas nuo nukleotidų šalinimo?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Pagrindo išpjaustymo ir nukleotidų pašalinimo taisymas |
|
| Bazės ekscizijos taisymas (BER) yra ląstelių DNR atstatymo sistema. | Nukleotidų ekscizijos taisymas (NER) yra dar viena DNR atstatymo sistemos rūšis, randama ląstelėse. |
| DNR aduktų atpažinimas | |
| BER atitaiso mažų DNR aduktų pažeidimus. | NER atstato didelius DNR aduktus. |
| DNR pažeidimai | |
| BER pripažįsta žalą, kuri nesukelia reikšmingų DNR spiralės iškraipymų. | NER pripažįsta žalą, sukeliančią reikšmingus DNR spiralės iškraipymus. |
| DNR pažeidimų priežastys | |
| BER ištaiso žalą, kurią sukelia endogeniniai mutagenai. | NER atitaiso egzogeninių mutagenų padarytą žalą. |
| Sudėtingumas | |
| BER yra mažiausiai sudėtinga remonto sistema | Tai yra sudėtingesnė nei BER. |
| Baltymų poreikis | |
| BER nereikia kitų baltymų. | NER reikalauja kelių genų produktų, ypač baltymų, kad būtų galima atskirti pažeistus ir nepažeistus regionus. |
| Tinkamumas | |
| BER yra tinkamas vieno pagrindo pažeidimams ištaisyti. | NER tinka pažeistiems regionams pakeisti. |
Santrauka - bazinės ekscizijos taisymas ir nukleotidų ekscizijos taisymas
NER ir BER yra dviejų tipų DNR ekscizijos atkūrimo procesai, randami ląstelėse. BER sugeba ištaisyti nedidelius endogeniškai padarytus nuostolius, o NER - iki 30 bazinių porų ilgio regionus, kuriuos dažniausiai sukelia išoriniai. BER skiriasi nuo NER atpažintų substratų tipais ir pradiniu skilimo įvykiu. BER taip pat gali pripažinti žalą, kuri nebuvo padaryta dėl reikšmingų DNR spiralės iškraipymų, o NER pripažįsta reikšmingus DNR spiralės iškraipymus. Tai yra skirtumas tarp bazės iškirpimo ir nukleotidų ekscizijos.
Vaizdo dovana:
1. „Dna repair base excersion en“, autorius LadyofHats - (viešasis domenas) per „Commons Wikimedia“
2. „Nukleotidų ekscizijos atkūrimo kelio, kurį kontroliuoja Uvr baltymai, modelių schema“Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui ir Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) per „Commons Wikimedia“
