Pagrindinis skirtumas tarp chemoorganotrofų ir chemolitotrofų yra tas, kad chemoorganotrofai yra organizmai, kurie elektronus gauna iš organinių junginių, tuo tarpu chemolitotrofai yra organizmai, kurie elektronus gauna iš neorganinių junginių.
Gyvus organizmus galima suskirstyti į kelias kategorijas, atsižvelgiant į mitybos būdą, atsižvelgiant į energijos ir anglies šaltinius. Yra saulės energijos šaltiniai ir organiniai junginiai. Panašiai yra dviejų rūšių anglies šaltiniai: neorganinė anglis ir organinė anglis. Keturios pagrindinės kategorijos yra fotoautotrofai, fotoheterotrofai, chemoautotrofai ir chemoheterotrofai. Be to, remiantis pirminiu ekvivalento redukcijos šaltiniu, yra dvi kategorijos: organotrofai ir litotrofai. Chemoorganotrofai ir chemolitotrofai yra dvi grupės, naudojančios energiją, susidariusią skaidant cheminius junginius. Bet jie skiriasi vienas nuo kito pagal elektronų donorą. Elektronų donoro šaltinis yra organiniai junginiai chemoorganotrofuose, o redukuojančio ekvivalento šaltinis yra neorganinis chemolitotrofuose.
