Pagrindinis skirtumas - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazės yra nukleazės, kurios specifiškai skaido RNR į mažesnius vienetus. Jas galima suskirstyti į dvi kategorijas; endoribonukleazės ir egzoribonukleazės. Endoribonukleazė yra endonukleazė, galinti arba suskaidyti viengrandę, arba dvigrandę RNR. Jis skaido fosfodiesterinius ryšius RNR polinukleotidų grandinėje. Pavyzdžiai yra RNazė A, RNazė III, RNazė T1, RNazė P ir RNazė H. Exoribonukleazė yra egzonukleazė, kuri suskaidė RNR pašalindama galinius nukleotidus iš RNR molekulės 5'-galo arba 3'-galo. Pavyzdžiai yra RNase R, RNase II, RNase D ir RNase PH. Pagrindinis skirtumas tarp RNASE A ir RNASE H yra tas, kad RNazė A yra kasos ribonukleazė, kuri specialiai skaido viengrandę RNR į mažesnius komponentus, o RNase H yra nespecifinis fermentas, kuris RNR-DNR hibride RNR suskaldo į mažesnius vienetus per hidrolizinis mechanizmas.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra RNASE A
3. Kas yra RNASE H
4. RNASE A ir RNASE H panašumai
5. Šoninis palyginimas - RNASE A ir RNASE H lentelės forma
6. Santrauka
Kas yra RNASE A?
RNazė A yra kasos ribonukleazė, kuri specialiai suskaido nesuporuotas citozino ir uracilo liekanas 3 'galuose vienos grandinės RNR. RNazė H veikia esant didesnei druskos koncentracijai (0,3 M arba didesnei NaCl koncentracijai). Hidrolizinė reakcija yra du etapai. Per 2 ', 3' ciklinį monofosfato tarpinį produktą jis sudaro 3 'fosforilintą produktą. Nors ji būdinga vienos grandinės RNR esant didesnei druskos koncentracijai, ji taip pat gali degraduoti RDA-DNR hibride esančią dvigubą grandinę RNR ir RNR esant mažesnei NaCl koncentracijai (mažesnė nei 0,3 M NaCl).
Pirmą kartą šį fermentą susintetino Bruce'as Merrifieldas. RNazė A yra labai populiarus fermentas atliekant molekulinius tyrimus. Galvijų kasos RNazė A yra RNazės A pavyzdys. Tai vienas iš sunkiausių fermentų, naudojamų laboratorijoje. Šio fermento veiklai kofaktoriaus nereikia. Tai labai termiškai stabilus fermentas. RNazė A yra pirmasis fermentas ir trečiasis baltymas, kurio aminorūgščių seka nustatyta teisingai. Šis fermentas yra labai mažas, jo sudėtyje yra 124 aminorūgštys, o molekulinė masė yra 12600da. Jame yra keturios histidino liekanos (jo 12 ir 119, kurios dalyvauja katalizinėje reakcijoje).
01 paveikslas: RNazė A
RNazę A galima išskirti virinant neapdorotą mėginį. Verdant visi kiti fermentai skaido likusią RNazę A. RNazė A yra nuostabiai stabilus fermentas. Šis fermentas slopina ribonukleazės inhibitoriaus baltymų, sunkiųjų metalų ir uridino vanadato kompleksus.
Kas yra RNase H?
RNazė H yra nespecifinis ribonukleazės fermentas, kuris hidrolizinės reakcijos metu gali suskaidyti RNR RNR-DNR hibride. RNazė H suardo RNR 3'- OP ryšį RNR-DNR hibride. Galiausiai jis gamina 3'OH ir 5 'fosfatų turinčius produktus. Atliekant DNR replikaciją, jis atlieka pagrindinį vaidmenį pašalindamas RNR pradmenį po to, kai susidaro naujos DNR grandinės. Laboratorijos sąlygomis jis specialiai skaido RNR-DNR hibridą, bet ne DNR ir nehibridizuotą RNR. Šis fermentas paprastai naudojamas RNR šablonui sunaikinti po to, kai cDNR sintezės metu susidaro pirmoji papildoma DNR grandinė.
02 paveikslas: RNazė H
RNazė H taip pat naudojama atliekant apsaugą nuo nukleazės. Jis taip pat gali būti įtrauktas į poli A uodegos pašalinimą iš iRNR. RNazė H turi galimybę sunaikinti nekoduojančią RNR ląstelės viduje ir išorėje. Metalo jonai reikalingi kaip kofaktoriai šiam baltymų aktyvumui. Chelatorius (EDTA) gali būti naudojamas RNazės H fermentui slopinti.
Kuo panašūs RNASE A ir RNASE H?
- Abu jie yra baltyminio pobūdžio.
- Abi yra endoribonukleazės
- Abu jie gali suskaidyti RNR.
- Abi vykdo hidrolizines reakcijas.
- Molekulinės laboratorijos naudoja šias abi.
Koks skirtumas tarp RNASE A ir RNASE H?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
RNASE A vs RNASE H |
|
RNazė A yra kasos ribonukleazė, kuri, esant didesnei druskos koncentracijai, specialiai suskaido nesuporuotų citozino ir uracilo liekanų 3-galus. | RNazė H yra nespecifinis ribonukleazės fermentas, kuris hidrolizinės reakcijos metu gali suardyti RNR RNR-DNR hibride. |
RNR skilimo pobūdis | |
RNazė A specialiai skaido vienos grandinės RNR esant didesnei druskos koncentracijai. | RNazė H skaido RNR RNR-DNR hibride. |
Veiklos veiksnių poreikis | |
RNase A veiklai nereikia kofaktorių. | RNase H veiklai reikalingi kofaktoriai metalo jonai. |
Baltymų aktyvumo inhibitoriai | |
Ribonukleazės inhibitoriaus baltymai, sunkiųjų metalų ir uridino vanadato kompleksai slopina RNR A aktyvumą. | Chelatorius (EDTA) slopina RNazės H aktyvumą. |
RNR pradmenų šalinimas atliekant DNR replikaciją | |
RNazė A nenaudojama RNR pradmenims pašalinti DNR replikacijos metu. | RNazė H naudojama RNR pradmenų pašalinimui DNR replikacijos metu |
DNR šablonų pašalinimas atliekant papildomą DNR (C-DNR) sintezę | |
RNazė A nenaudojama RNR šablonui pašalinti vykstant komplementinei DNR (C-DNR) sintezei. | RNazė H naudojama RNR šablonui pašalinti komplementarios DNR (C-DNR) sintezės metu. |
Poli-A-uodegos pašalinimas iRNR, hibridizuotoje su Oligo (dt) | |
RNazė A nenaudojama pašalinant „poli-A uodegą“iRNR, hibridizuotoje su oligo (dt). | RNazė H naudojama pašalinti „poli-A uodegą“iRNR, hibridizuotoje su oligo (dt) |
Santrauka - RNASE A vs RNASE H
Ribonukleazės yra nukleazės fermentai, turintys galimybę suskaidyti RNR į mažesnius vienetus. Jie yra dviejų tipų; endoribonukleazės ir egzoribonukleazės. Endoribonukleazė yra endonukleazė, galinti skaidyti viengrandę arba dvigrandę RNR. Jis suardo fosfodiesterio ryšį RNR polinukleotidų grandinėje. RNazė A ir RNazė H yra dvi endoribonukleazės. RNazė A yra kasos ribonukleazė, kuri specialiai suskaido nesuporuotas citozino ir uracilo liekanas 3-jų galų viengrandės RNR, esant didesnei druskos koncentracijai. RNazė H yra nespecifinis ribonukleazės fermentas, kuris hidrolizinės reakcijos metu gali suardyti RNR RNR-DNR hibride. Tai yra skirtumas tarp RNazės A ir RNazės H.
Atsisiųskite PDF RNASE A vs RNASE H
Galite atsisiųsti šio straipsnio PDF versiją ir naudoti ją neprisijungus, kaip nurodyta citatos pastaboje. Atsisiųskite PDF versiją čia Skirtumas tarp RNASE A ir RNASE H