Pagrindinis skirtumas - endonukleazė ir eksonukleazė
Prieš nagrinėjant skirtumą tarp endonukleazės ir egzonukleazės, svarbu žinoti, kas tiksliai yra nukleazė. Nukleazė yra fermentas, galintis skaidyti fosfodiesterinius ryšius tarp nukleotidų nukleorūgštyse. Endonukleazė ir egzonukleazė yra dvi branduolių klasifikacijos. Pagrindinis skirtumas tarp endonukleazės ir egzonukleazės yra tas, kad endonukleazės nutraukia ryšius tarp nukleotidų nukleorūgšties molekulėje, o egzonukleazės - nukleotidų jungtį nukleorūgšties molekulės 3 ’arba 5’ galuose.
TURINYS
1. Apžvalga ir pagrindiniai skirtumai
2. Kas yra
nukleazė 3. Kas yra endonukleazė
4. Kas yra egzonukleazė
5. Palyginimas greta - endonukleazė ir eksonukleazė
6. Santrauka
Kas yra Nuclease?
Nukleazė yra fermentas, turintis galimybę suskaidyti fosfodiesterinius ryšius tarp nukleotidų nukleorūgštyse. Jis priklauso hidrolazės fermentų grupei, nes hidrolizuoja cheminius ryšius tarp nukleotidų. Šis fermentas yra būtinas natūraliems DNR atstatymo mechanizmams, vykstantiems ląstelėse, ir biotechnologiniuose procesuose, tokiuose kaip genų klonavimas, rekombinantinės DNR technologijos, RFLP, AFLP, genų sekos nustatymas, genų terapija, genomo kartografavimas ir kt.
Yra du pagrindiniai nukleazių tipai: ribonukleazė ir deoksiribonukleazė, veikiančios ir nutraukiančios cheminius ryšius tarp RNR ir DNR monomerų. Pagal nukleazių veikimo vietą jie dar skirstomi į dvi grupes, būtent endonukleazę ir egzonukleazę. Endonukleazės atpažįsta specifines nukleorūgščių sekos sritis ir skaido fosfodiesterinius ryšius tarp nukleotidų, esančių nukleorūgščių viduryje. Egzonukleazės skaido fosfodiesterinius ryšius tarp nukleotidų, esančių nukleorūgščių galuose.
1 paveikslas: Nukleazės aktyvumas
Kas yra endonukleazė?
Endonukleazė yra tam tikros rūšies nukleazės, kurios skaldo nukleorūgštis iš vidurio. Jis atpažįsta specifines nukleorūgščių nukleotidų sekas ir nutraukia cheminius ryšius tarp nukleotidų. Jie taip pat žinomi kaip restrikcijos endonukleazės, nes jie ieško specifinių restrikcijos vietų, nutraukia ryšį ir gamina restrikcijos fragmentus. Bakterijose ir archėjose yra nustatyta daugiau nei 100 restrikcijos endonukleazių ir gaunama komerciniais tikslais.
Ribojamosios endonukleazės plačiai naudojamos biotechnologijose. Jie vaidina gyvybiškai svarbų vaidmenį atliekant molekulinį klonavimą. Dauguma jų yra dimeriniai fermentai, susidedantys iš dviejų baltymų subvienetų. Du baltymų subvienetai apvynioja dvigubą DNR ir atskirai iš abiejų pusių išpjauna abi grandines. Yra šimtai restrikcijos endonukleazių rūšių, turinčių unikalias bakterijų atpažinimo vietas. Dėl didelio specifiškumo ribojime jie skilinėja tik ties specifinėmis sekomis. Taigi jie laikomi labai naudingais molekuliniais įrankiais rekombinantinėje DNR technologijoje. Be restrikcinių endonukleazių, neįmanoma gaminti rekombinantinės DNR molekulės. Rekombinantinės DNR molekulės sukūrimas yra pagrindinis daugelio molekulinių biologinių technologijų žingsnis.
Šis pavyzdys padės skaitytojams suprasti unikalų sekos atpažinimą pagal restrikcijos endonukleazes.
Bam HI yra restrikcijos endonukleazė, kuri DNR molekulėje ieško šios restrikcijos vietos (vieta parodyta raudonomis raidėmis).
Kai Bam HI atskaldo nukleino rūgštį iš restrikcijos vietos, ji gamina šiuos du fragmentus.
„EcoRI“yra dar viena restrikcijos endonukleazė, labai naudinga rekombinantinėje DNR technologijoje, veikia savo specifinę restrikcijos atpažinimo vietą ir skaido DNR, kaip parodyta 2 paveiksle.
2 paveikslas: EcoRI
Kas yra Exonuclease?
Exonukleazė yra nukleazės fermentas, kuris nutraukia cheminius ryšius tarp nukleotidų nukleorūgščių grandinės 3 'arba 5' galuose. Jis pertraukia pavienius nukleotidus grandinės gale ir gamina nukleozidus perkeliant fosfato grupes į vandenį. Egzonukleazės yra archėjose, bakterijose ir eukariotuose. E coli yra 17 skirtingų egzonukleazių, įskaitant 1, 2 ir 3 DNR polimerus. Kelios DNR polimerazės turi 3 '- 5' egzonukleazės korektūros aktyvumą.
Egzonukleazės yra svarbios taisant DNR, atliekant genetinę rekombinaciją, užkertant kelią mutacijų atsiradimui, genomo stabilizavimui ir kt.
3 paveikslas: E Coli RecBCD eksonukleazinis veikimas
Kuo skiriasi endonukleazė ir egzonukleazė?
Skirtingas straipsnis viduryje prieš lentelę
Endonukleazė prieš eksonukleazę |
|
| Endonukleazė yra tam tikras nukleazės fermentų tipas, kuris nutraukia ryšius tarp nukleotidų nukleorūgšties molekulėje. | Egzonukleazė yra tam tikros rūšies nukleazės fermentai, nutraukiantys ryšį tarp nukleotidų nukleorūgšties molekulės 3 ’arba 5’ galuose. |
| Galutiniai produktai | |
| Endonukleazės gamina oligonukleotidų restrikcijos fragmentus | Exonukleotidai gamina nukleozidus |
| Funkcija | |
| Jie nutraukia fosfodiesterio ryšius ir gamina restrikcijos fragmentus. Bet jie po vieną pašalina nukleotidus. | Jie po vieną pašalina nukleotidus iš nukleorūgščių galų. |
| Pavyzdžiai | |
| Pavyzdžiui, „Bam HI“, „EcoRI“, „Hind III“, „Hpa I“, „Sma I“, | Tokie pavyzdžiai yra I, III, RecBCD (V eksonukleazė), RecJ, VIII / RecE, IX, IX, T, X ir kt. |
Santrauka - Endonukleazė ir Exonukleazė
Nukleazės yra atsakingos už fosfodiesterio cheminių ryšių pertraukimą tarp nukleorūgščių nukleotidų. Nukleazės gali veikti nukleorūgščių grandinės viduje arba galuose. Pagal veikimo vietą organizmuose yra du pagrindiniai nukleazių tipai. Jie yra endonukleazė ir egzonukleazė. Endonukleazės skaldo nukleotidus nuo grandinės vidurio, o egzonukleazės - nukleotidus iš nukleorūgščių grandinės galų. Rekombinantinės DNR technologijoje endonukleazės yra labai svarbios, nes jos atpažįsta specifines bazių sekas nukleorūgščių grandinėje ir nutraukia ryšius tarp nukleotidų.
