Pagrindinis skirtumas tarp CDS ir cDNR yra tas, kad CDS arba koduojanti seka yra transkripcijos dalis, kuri iš tikrųjų yra išversta į baltymą, o cDNR seka yra DNR seka, gaunama iš mRNR atvirkštine transkripcija.
Genas yra nukleotidų seka, koduojanti baltymą. Jį sudaro skirtingi regionai, kaip promotoriaus sritis, transkripcijos inicijavimo vieta, egzonai, pradinis kodonas, intronai ir stop kodonas. Todėl genas turi ir koduojančias, ir nekoduojančias sekas. Koduojančios sekos arba CDS reiškia egzonus ir du kodonus, kurie yra pradinis kodonas ir sustabdymo kodonas. Tai seka, kuri iš tikrųjų paverčiama baltymu. Priešingai, cDNR yra DNR seka, gaunama iš iRNR atvirkštinės transkripcijos būdu.
