Pagrindinis skirtumas tarp kolonizacijos ir infekcijos yra tas, kad kolonizacija yra mikrobo įsitvirtinimo kūno audiniuose procesas, o infekcija yra mikrobo įsiskverbimo į kūno audinius procesas, sukeliantis ligos simptomus.
Mikrobų patogeniškumas yra visiškas biocheminis ir struktūrinis procesas, kurį apibrėžia visas mechanizmas, kuriuo mikroorganizmas sukelia ligą. Pavyzdžiui, bakterijų patogeniškumas gali būti siejamas su skirtingais bakterinės ląstelės komponentais, tokiais kaip kapsulė, fimbrijos, lipopolisacharidai (LPS) ir kiti ląstelės sienelės komponentai. Mes taip pat galime susieti su aktyviu medžiagų išsiskyrimu, kuris pažeidžia audinius šeimininkus arba apsaugo bakterijas nuo šeimininko gynybos. Kolonizacija ir infekcija yra du mikrobų patogeniškumo terminai. Pirmasis mikrobų patogeniškumo etapas yra kolonizacija. Jis žinomas kaip teisingas patogeno nustatymas audiniuose šeimininkuose. Priešingai, infekcija yra ligos sukėlėjo patogeno invazija į kūno audinius.
