Pagrindinis skirtumas tarp Krebso ciklo ir glikolizės yra tas, kad Krebso ciklas, vykstantis mitochondrijose, yra antrasis ląstelinio kvėpavimo etapas, o citoplazmoje vykstanti glikolizė yra pirmoji ląstelinio kvėpavimo stadija.
Krebso ciklas ir glikolizė yra du pagrindiniai ląstelių kvėpavimo etapai, kurie ląstelėse gamina energiją. Abu procesai vyksta skirtingose ląstelių vietose. Be to, jie naudoja skirtingas fermentines reakcijas, kad skirtingas pradines medžiagas paverstų skirtingais produktais. Be to, šie du procesai sukuria skirtingą ATP kiekį. Aerobinio kvėpavimo metu Krebso ciklas seka glikolizę. Bet anaerobinio kvėpavimo metu glikolizė vyksta atskirai.